為更好地幫助到想要利用腦電圖技術(shù)開展科研的朋友們,拓展思影科技的業(yè)務(wù)范圍,思影科技推出腦電機(jī)器學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù),如感興趣請聯(lián)系楊曉飛siyingyxf或18983979082(微信號)進(jìn)行咨詢,電話:18580429226.
一、數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查和預(yù)處理
數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查包括:檢查是否存在壞的導(dǎo)聯(lián)、Marker信息是否完整、信號是否有過大的波動或漂移等。
數(shù)據(jù)預(yù)處理包括:數(shù)據(jù)導(dǎo)入(格式轉(zhuǎn)換)、定位電極、濾波、重參考、分段、手工去除偽跡(壞段、壞導(dǎo)聯(lián))、偽跡校正(基于ICA去眼電等)。
注:預(yù)處理步驟可根據(jù)實際實驗任務(wù)加以調(diào)整。
二、EEG基礎(chǔ)指標(biāo)計算
(1)計算ERP波幅。對于事件相關(guān)的實驗數(shù)據(jù),通過疊加平均的方式,計算特定刺激誘發(fā)的ERP波幅。
(2)計算功率譜。對于靜息態(tài)實驗數(shù)據(jù),通過傅里葉變換,計算各波段(delta ~ gamma)的功率譜密度(PSD)。
(3)計算時頻特征。通過短時傅里葉變換(或小波變換),計算時頻圖(power)。
(4)計算功能連通性(腦網(wǎng)絡(luò))。對于靜息態(tài)實驗數(shù)據(jù),計算通道之間的功能連通性,所有通道之間的功能連通性可構(gòu)成腦網(wǎng)絡(luò)。功能連通性的計算方式可選:相干(Coherence)、相位鎖定值(PLV)等。
三、 特征構(gòu)建與特征篩選3.1 特征構(gòu)建
1.ERP特征。計算感興趣通道的ERP幅值后,每個時間點的ERP幅值可以作為一個特征。
2. 功率譜特征。計算各區(qū)域(或各通道)在每個波段(delta
~ gamma)的功率譜。單一區(qū)域(或通道)的某波段的平均絕對/相對功率譜密度(PSD/rPSD),可以作為一個特征。區(qū)域的分辨率可調(diào)節(jié)(如按照10-5、10-20系統(tǒng)選擇通道)。
圖示.各組別各波段的功率譜密度分布。
3.信息論特征。計算各區(qū)域(或各通道)的排列熵,Kolmogorov復(fù)雜度等指標(biāo),每個區(qū)域(或通道)的信息論指標(biāo)可以作為一個特征。
4.地形圖特征。計算時域或頻域幅值的地形圖,使用地形圖或其衍生指標(biāo)(如GFP,Global Field Power)作為特征。
5.腦網(wǎng)絡(luò)。將每個通道視為一個節(jié)點,節(jié)點之間的聯(lián)系(功能連通性)視為一條連邊,每條連邊即為一個特征。
圖示. 頻譜、信息論、功能連通性等多種特征的組合。
6.RQA特征。對于各通道的靜息態(tài)數(shù)據(jù),基于相位空間構(gòu)建遞歸圖,進(jìn)行遞歸量化分析(Recurrence quantification analysis),提取遞歸率(RR)、決定論(DET)、熵(ENTR)、分層性(LAM)等作為特征。
3.2 特征篩選
1.相關(guān)法。計算每個特征與量表的相關(guān)性(如皮爾遜相關(guān)),保留相關(guān)值高的特征。
2.參數(shù)檢驗法。對不同組別人群的特征做假設(shè)檢驗(比如對兩組人群的特征做雙樣本T檢驗),保留通過假設(shè)檢驗的特征。
3.主成分分析(PCA)法。將所有特征分解成一系列主成分,保留排名靠前的主成分作為特征。
4.遞歸特征消除法。循序漸進(jìn)地刪除影響最小的特征,直至保留特定數(shù)目的最重要的特征為止。注:我們可以提供的特征構(gòu)建、特征篩選方法包括但不限于上述描述,您可以選擇其中一種或多種進(jìn)行組合。
三、機(jī)器學(xué)習(xí)模型
1.K近鄰(k-Nearest Neighbor,KNN)。K近鄰是一個比較基礎(chǔ)的分類算法,該算法計算測試樣本與已知樣本之間的距離,并將測試樣本判定為與其距離最近的類別。
2.決策樹(Decision Tree)。該模型選用一些特征作為決策變量,基于特定的閾值形成決策分支,最終形成樹狀的決策鏈條。
3.支持向量機(jī)(SVM)。在許多情況下,支持向量機(jī)都是二分類模型的首選。通過使用核函數(shù),即使基于線性不可分的數(shù)據(jù),也可獲得較好的分類精度。引入投票機(jī)制后,亦可將該模型應(yīng)用于多分類場景。
圖示.使用SVM進(jìn)行訓(xùn)練的過程。
4.集成學(xué)習(xí)。當(dāng)單一的分類器性能不良時,可以考慮集成多個弱分類器,形成一個強(qiáng)分類器??蛇x的集成學(xué)習(xí)模型有隨機(jī)森林等。
圖示.隨機(jī)森林分類過程。
5回歸模型?;貧w模型主要用于預(yù)測連續(xù)變量(如量表得分)??蛇x的回歸模型有線性回歸(GLM)、多項式回歸等,也包含其變種,如LASSO回歸、嶺回歸、Elastic Net等。
6.神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。當(dāng)沒有良好的手工選擇的特征時,可以考慮選用深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(主要基于CNN來實現(xiàn))模型。該模型可以自動從原始數(shù)據(jù)中提取特征,用于后續(xù)的預(yù)測任務(wù)。
圖示.一種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)。
7.聚類。當(dāng)數(shù)據(jù)沒有標(biāo)簽時,可以選擇無監(jiān)督學(xué)習(xí)算法,如K-means聚類。
注:思影可以提供的機(jī)器學(xué)習(xí)模型包括但不限于以上內(nèi)容。其他模型如樸素貝葉斯(Naive Bayes)、線性判別分析(LDA)、主成分分析(PCA)、或上述模型的變種,亦可根據(jù)需求實現(xiàn)。您可以選擇其中的一種或多種進(jìn)行嘗試。
一、結(jié)果匯報&可視化
結(jié)果匯報內(nèi)容包括:
(1)對于分類模型,可匯報敏感性、特異性、總精度、曲線下面積等精度指標(biāo);
(2)對于回歸模型,可以匯報相關(guān)值、MSE、MAE等精度指標(biāo);
(3)置換檢驗的結(jié)果,如p值。
圖示.精度結(jié)果可視化案例。
圖示.ROC曲線可視化。
結(jié)果可視化內(nèi)容包括:
(1)對于分類模型,可繪制ROC曲線圖;
(2)對于回歸模型,可繪制相關(guān)圖;
(3)對于模型訓(xùn)練過程中發(fā)現(xiàn)的貢獻(xiàn)較大的特征,可繪制曲線圖、矩陣圖、圈狀圖、地形圖等。
圖示.頻譜特征結(jié)果可視化案例。
五、定制化服務(wù)
圖示.工程師在討論。
1.分析方法可定制。思影科技可根據(jù)您提供的模板文獻(xiàn),基于您的實驗數(shù)據(jù),實現(xiàn)文獻(xiàn)中使用的數(shù)據(jù)分析方法。此外,未列出的分析方法,只要在思影科技的能力范圍內(nèi),盡力實現(xiàn)您的想法。
2.分析代碼可定制。在沒有現(xiàn)有的軟件適用于您的數(shù)據(jù)分析需求時,思影科技會與您協(xié)商,通過編寫代碼實現(xiàn)您的想法,并提供代碼的完整實現(xiàn)。
3.可視化方案可定制。如果您有特殊的可視化方案要求,也可與我們協(xié)商實現(xiàn)。
客戶與思影確定合作意向以后,思影會指定專門的工程師全程與客戶對接項目著手該項目數(shù)據(jù)處理,思影額外還將指派另一名工程師對項目全程進(jìn)行檢查,審核,把關(guān),確保數(shù)據(jù)處理質(zhì)量,思影將全程對客戶數(shù)據(jù)保密。
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更新通知:第二十八屆磁共振腦影像基礎(chǔ)班(重慶,已確定)
更新通知:第十屆腦影像機(jī)器學(xué)習(xí)班(已確定)
更新通知:第十二屆磁共振彌散張量成像數(shù)據(jù)處理班(已確定)
第六屆任務(wù)態(tài)fMRI專題班(預(yù)報名,南京)